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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Uva e Vinho. |
Data corrente: |
22/05/2014 |
Data da última atualização: |
02/04/2019 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
NICKEL, O.; FAJARDO, T. V. M. |
Afiliação: |
OSMAR NICKEL, CNPUV; THOR VINICIUS MARTINS FAJARDO, CNPUV. |
Título: |
Detection of Viruses in Apples and Pears by Real Time RT-PCR Using 5'-Hydrolysis Probes |
Ano de publicação: |
2014 |
Fonte/Imprenta: |
Journal of Plant Pathology, v. 96, n. 1, p. 207-213, 2014. |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
Apple stem pitting virus (ASPV), Apple stem grooving virus (ASGV), Apple chlorotic leaf spot virus (ACLSV) and Apple mosaic virus (ApMV) are common in apples and pears and the main targets of virus elimination from propagation material. The objective of this work was to design primers and probes for a real time RT-PCR protocol for detection of the four above viruses. FAM/TAMRA-labeled probes and primers were designed by searching for highly conserved nucleotide regions in the coat protein gene of the four viruses. Infection levels in analyzed apple samples were 92.6, 96.4, 100 and 88% for ASGV, ASPV, ACLSV and ApMV, respectively. In pears, all pre-existing ASPV infections were detected. Viral infections were confirmed in a selection of commercial cultivars of apples and pear scions, and quince rootstocks, demonstrating the sensitivity and reliability of the designed primers and probes. Real time RT-PCR using 5'-labeled probes is suitable for checking sanitary quality as a routine test in certification programs. |
Palavras-Chave: |
RT-PCR. |
Thesagro: |
DNA; Maça; Pera; Virus. |
Thesaurus Nal: |
Apple chlorotic leaf spot virus; Apple mosaic virus; Apple stem grooving virus; Apple stem pitting virus; Fruit quality; Reverse transcriptase polymerase chain reaction. |
Categoria do assunto: |
-- |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/102459/1/JPP-2014-RT-PCR-Virus-macieira-Nickel-Thor.pdf
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Marc: |
LEADER 01817naa a2200265 a 4500 001 1986801 005 2019-04-02 008 2014 bl uuuu u00u1 u #d 100 1 $aNICKEL, O. 245 $aDetection of Viruses in Apples and Pears by Real Time RT-PCR Using 5'-Hydrolysis Probes$h[electronic resource] 260 $c2014 520 $aApple stem pitting virus (ASPV), Apple stem grooving virus (ASGV), Apple chlorotic leaf spot virus (ACLSV) and Apple mosaic virus (ApMV) are common in apples and pears and the main targets of virus elimination from propagation material. The objective of this work was to design primers and probes for a real time RT-PCR protocol for detection of the four above viruses. FAM/TAMRA-labeled probes and primers were designed by searching for highly conserved nucleotide regions in the coat protein gene of the four viruses. Infection levels in analyzed apple samples were 92.6, 96.4, 100 and 88% for ASGV, ASPV, ACLSV and ApMV, respectively. In pears, all pre-existing ASPV infections were detected. Viral infections were confirmed in a selection of commercial cultivars of apples and pear scions, and quince rootstocks, demonstrating the sensitivity and reliability of the designed primers and probes. Real time RT-PCR using 5'-labeled probes is suitable for checking sanitary quality as a routine test in certification programs. 650 $aApple chlorotic leaf spot virus 650 $aApple mosaic virus 650 $aApple stem grooving virus 650 $aApple stem pitting virus 650 $aFruit quality 650 $aReverse transcriptase polymerase chain reaction 650 $aDNA 650 $aMaça 650 $aPera 650 $aVirus 653 $aRT-PCR 700 1 $aFAJARDO, T. V. M. 773 $tJournal of Plant Pathology$gv. 96, n. 1, p. 207-213, 2014.
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Registro original: |
Embrapa Uva e Vinho (CNPUV) |
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Biblioteca |
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Tipo/Formato |
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Registro |
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Status |
URL |
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Registros recuperados : 69 | |
3. | | TEIXEIRA, M. A.; BETTIOL, W.; CESNIK, R. Colletotrichum gloeosporioides agente de controle biologico de Orthezia praelonga dos citros e fitopatogenico? In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FITOPATOLOGIA, 31., 1993, Fortaleza, CE. Fitopatologia Brasileira, Brasilia, v.23, p.287, ago. 1998. Suplemento.Resumos. ref.433.Biblioteca(s): Embrapa Meio Ambiente. |
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4. | | TEIXEIRA, M. A.; VIEIRA, R. F. Indicadores de qualidade do solo em áreas cultivadas com morango e submetidas a diferentes práticas de manejo do solo. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 28.; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 12.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 10.; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 7., 2008, Londrina. FertBio 2008: desafios para o uso do solo com eficiência e qualidade ambiental: anais. Londrina: Embrapa Soja: SBCS: IAPAR, UEL, 2008. 4p. CD-ROM.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Meio Ambiente. |
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5. | | TEIXEIRA, M. A.; VIEIRA, R. F. Indicadores de qualidade do solo em áreas cultivadas com morango e submetidas a diferentes práticas de manejo do solo. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 28.; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 12.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 10.; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 7., 2008, Londrina. FertBio 2008: desafios para o uso do solo com eficiência e qualidade ambiental: resumos. Londrina: Embrapa Soja: SBCS: IAPAR, UEL, 2008. 1 CD-ROM.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Meio Ambiente. |
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7. | | VIEIRA, R. F.; TEIXEIRA, M. A.; DIAS, A. N. L. Atividade microbiana em solos suplementados com lodos de esgoto contendo altos e baixos teores de metais pesados. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 28.; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 12.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 10.; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 7., 2008, Londrina. FertBio 2008: desafios para o uso do solo com eficiência e qualidade ambiental: anais. Londrina: Embrapa Soja: SBCS: IAPAR, UEL, 2008. 4p. CD-ROM.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Meio Ambiente. |
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8. | | VIEIRA, R. F.; TEIXEIRA, M. A.; DIAS, A. N. L. Atividade microbiana em solos suplementados com lodos de esgoto contendo altos e baixos teores de metais pesados. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 28.; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 12.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 10.; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 7., 2008, Londrina. FertBio 2008: desafios para o uso do solo com eficiência e qualidade ambiental: resumos. Londrina: Embrapa Soja: SBCS: IAPAR, UEL, 2008. 1 CD-ROM.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Meio Ambiente. |
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12. | | VIEIRA, R. F.; TSAI, S. M.; TEIXEIRA, M. A. Nodulação e fixação simbiótica de nitrogênio em feijoeiro com estirpes nativas de rizóbio, em solo tratado com lodo de esgoto. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 40, n. 10, p. 1047-1050, out. 2005. Notas científicas.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - A |
Biblioteca(s): Embrapa Meio Ambiente; Embrapa Unidades Centrais. |
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13. | | TEIXEIRA, M. A.; BETTIOL, W.; CESNIK, R.; VIEIRA, R. F. Patogenicidade do fungo Colletotrichum gloeosporioides, patógeno da cochonilha Orthezia praelonga, a diversos frutos e a plântulas de abobrinha. Revista Brasileira de Fruticultura, Cruz das Almas, v. 26, n. 2, p. 356-358, ago. 2004.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Nacional - A |
Biblioteca(s): Embrapa Meio Ambiente. |
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16. | | TEIXEIRA, M. A.; DIAS, A. N. L.; VIEIRA, R. F.; ARAÚJO, E. S. de. Bactérias endofíticas do morangueiro antagônicas ao fungo Pestalotiopsis longisetula. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 28.; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 12.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 10.; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 7., 2008, Londrina. FertBio 2008: desafios para o uso do solo com eficiência e qualidade ambiental: anais. Londrina: Embrapa Soja: SBCS: IAPAR, UEL, 2008. 4p. CD-ROM.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Meio Ambiente. |
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17. | | TEIXEIRA, M. A.; DIAS, A. N. L.; VIEIRA, R. F.; ARAÚJO, E. S. de. Bactérias endofíticas do morangueiro antagônicas ao fungo Pestalotiopsis longisetula. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 28.; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 12.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 10.; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 7., 2008, Londrina. FertBio 2008: desafios para o uso do solo com eficiência e qualidade ambiental: resumos. Londrina: Embrapa Soja: SBCS: IAPAR, UEL, 2008. 1 CD-ROM.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Meio Ambiente. |
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18. | | ANDREOTE, F. D.; TEIXEIRA, M. A.; DIAS, A. C. F.; VIEIRA, R. F. Análise da diversidade de proteobacterias e actinobacterias em solos cultivados com morango sob diferentes práticas de manejo. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 28.; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 12.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 10.; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 7., 2008, Londrina. FertBio 2008: desafios para o uso do solo com eficiência e qualidade ambiental: anais. Londrina: Embrapa Soja: SBCS: IAPAR, UEL, 2008. 4p. CD-ROM.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Meio Ambiente. |
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19. | | ANDREOTE, F. D.; TEIXEIRA, M. A.; DIAS, A. C. F.; VIEIRA, R. F. Análise da diversidade de proteobactérias e actinobactérias em solos cultivados com morango sob diferentes práticas de manejo. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 28.; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 12.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 10.; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 7., 2008, Londrina. FertBio 2008: desafios para o uso do solo com eficiência e qualidade ambiental: resumos. Londrina: Embrapa Soja: SBCS: IAPAR, UEL, 2008. 1 CD-ROM.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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